MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 3151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002682	GCG	2	6	79367	79372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488457
1002	NC_002682	GAG	2	6	79381	79386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488457
1003	NC_002682	TCA	2	6	79404	79409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488457
1004	NC_002682	CCT	2	6	79410	79415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488457
1005	NC_002682	GCC	2	6	79455	79460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488457
1006	NC_002682	CG	3	6	79507	79512	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
1007	NC_002682	CCG	2	6	79637	79642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488457
1008	NC_002682	TGGT	2	8	79648	79655	0 %	50 %	50 %	0 %	13488457
1009	NC_002682	CAG	2	6	79660	79665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488457
1010	NC_002682	AGGT	2	8	79733	79740	25 %	25 %	50 %	0 %	13488457
1011	NC_002682	GT	3	6	79743	79748	0 %	50 %	50 %	0 %	13488457
1012	NC_002682	TCA	2	6	79751	79756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488457
1013	NC_002682	AGC	2	6	79790	79795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488457
1014	NC_002682	GC	3	6	79826	79831	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
1015	NC_002682	GC	3	6	79889	79894	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
1016	NC_002682	GCG	2	6	79908	79913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488457
1017	NC_002682	CAGGAA	2	12	79915	79926	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	13488457
1018	NC_002682	TCG	2	6	79964	79969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488457
1019	NC_002682	CGA	2	6	80090	80095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488457
1020	NC_002682	TTG	2	6	80102	80107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488457
1021	NC_002682	GCC	3	9	80117	80125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488457
1022	NC_002682	CCG	2	6	80133	80138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488457
1023	NC_002682	CGG	2	6	80142	80147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488457
1024	NC_002682	CG	3	6	80171	80176	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
1025	NC_002682	TTG	2	6	80198	80203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488457
1026	NC_002682	CAC	2	6	80206	80211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488457
1027	NC_002682	CGA	2	6	80220	80225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488457
1028	NC_002682	GGCG	2	8	80253	80260	0 %	0 %	75 %	25 %	13488457
1029	NC_002682	CGG	2	6	80267	80272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488457
1030	NC_002682	TCA	2	6	80286	80291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488457
1031	NC_002682	GGC	2	6	80372	80377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488458
1032	NC_002682	GAG	2	6	80411	80416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488458
1033	NC_002682	CG	3	6	80485	80490	0 %	0 %	50 %	50 %	13488458
1034	NC_002682	GC	3	6	80491	80496	0 %	0 %	50 %	50 %	13488458
1035	NC_002682	GTT	2	6	80563	80568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488458
1036	NC_002682	GCC	2	6	80577	80582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488458
1037	NC_002682	CGC	2	6	80598	80603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488458
1038	NC_002682	GAA	2	6	80611	80616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488458
1039	NC_002682	AGAA	2	8	80621	80628	75 %	0 %	25 %	0 %	13488458
1040	NC_002682	CGC	2	6	80635	80640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488458
1041	NC_002682	GA	3	6	80651	80656	50 %	0 %	50 %	0 %	13488458
1042	NC_002682	GCC	2	6	80686	80691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488458
1043	NC_002682	GAT	4	12	80728	80739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488458
1044	NC_002682	CGAC	2	8	80769	80776	25 %	0 %	25 %	50 %	13488458
1045	NC_002682	GAG	2	6	80813	80818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488458
1046	NC_002682	CG	3	6	81010	81015	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1047	NC_002682	GAC	2	6	81081	81086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1048	NC_002682	GCT	2	6	81101	81106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1049	NC_002682	GGC	2	6	81110	81115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488460
1050	NC_002682	GC	3	6	81119	81124	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1051	NC_002682	CCA	2	6	81157	81162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488460
1052	NC_002682	TCGG	2	8	81231	81238	0 %	25 %	50 %	25 %	13488460
1053	NC_002682	GCG	2	6	81319	81324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488460
1054	NC_002682	GAC	2	6	81354	81359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1055	NC_002682	GTCC	2	8	81363	81370	0 %	25 %	25 %	50 %	13488460
1056	NC_002682	AGC	2	6	81388	81393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1057	NC_002682	CGT	2	6	81405	81410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1058	NC_002682	GCC	2	6	81426	81431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488460
1059	NC_002682	CG	3	6	81447	81452	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1060	NC_002682	GGCC	2	8	81485	81492	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1061	NC_002682	CGC	2	6	81504	81509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488460
1062	NC_002682	ACGGCG	2	12	81532	81543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488460
1063	NC_002682	CCA	2	6	81572	81577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488460
1064	NC_002682	GGC	2	6	81580	81585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488460
1065	NC_002682	ATG	2	6	81666	81671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488460
1066	NC_002682	CGGC	2	8	81701	81708	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1067	NC_002682	GAAA	2	8	81742	81749	75 %	0 %	25 %	0 %	13488460
1068	NC_002682	CGA	2	6	81788	81793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1069	NC_002682	TCG	2	6	81802	81807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1070	NC_002682	GGCC	2	8	81822	81829	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1071	NC_002682	GCA	2	6	81842	81847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488460
1072	NC_002682	GC	4	8	81858	81865	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
1073	NC_002682	GTG	2	6	82309	82314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488461
1074	NC_002682	GAC	2	6	82444	82449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488461
1075	NC_002682	GTC	3	9	82505	82513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488461
1076	NC_002682	CTA	2	6	82528	82533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488461
1077	NC_002682	TGC	2	6	82536	82541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488461
1078	NC_002682	CGG	2	6	82603	82608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488461
1079	NC_002682	GCCA	2	8	82613	82620	25 %	0 %	25 %	50 %	13488461
1080	NC_002682	CCG	2	6	82650	82655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488461
1081	NC_002682	CT	3	6	82685	82690	0 %	50 %	0 %	50 %	13488461
1082	NC_002682	TCA	2	6	82752	82757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488461
1083	NC_002682	TC	3	6	82794	82799	0 %	50 %	0 %	50 %	13488461
1084	NC_002682	CTG	2	6	82883	82888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488461
1085	NC_002682	CTT	2	6	82891	82896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488461
1086	NC_002682	CGT	2	6	82897	82902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488461
1087	NC_002682	CTG	2	6	83037	83042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488462
1088	NC_002682	GAT	2	6	83093	83098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488462
1089	NC_002682	CGGCG	2	10	83100	83109	0 %	0 %	60 %	40 %	13488462
1090	NC_002682	CCGT	2	8	83128	83135	0 %	25 %	25 %	50 %	13488462
1091	NC_002682	CGGT	2	8	83233	83240	0 %	25 %	50 %	25 %	13488462
1092	NC_002682	TAC	2	6	83259	83264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488462
1093	NC_002682	CAG	2	6	83319	83324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488462
1094	NC_002682	AGC	2	6	83327	83332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488462
1095	NC_002682	GCC	2	6	83350	83355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488462
1096	NC_002682	CGC	2	6	83380	83385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488462
1097	NC_002682	GCA	2	6	83403	83408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488462
1098	NC_002682	GCTC	2	8	83632	83639	0 %	25 %	25 %	50 %	13488463
1099	NC_002682	CAA	2	6	83698	83703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488463
1100	NC_002682	CG	3	6	83750	83755	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
1101	NC_002682	TCG	2	6	83766	83771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488463
1102	NC_002682	GCT	2	6	83811	83816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488463
1103	NC_002682	GAT	2	6	83845	83850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488463
1104	NC_002682	A	6	6	83875	83880	100 %	0 %	0 %	0 %	13488463
1105	NC_002682	GC	3	6	83900	83905	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
1106	NC_002682	GCA	2	6	84031	84036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488463
1107	NC_002682	CGG	2	6	84042	84047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488463
1108	NC_002682	CAA	3	9	84098	84106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488463
1109	NC_002682	CG	3	6	84118	84123	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
1110	NC_002682	CAT	2	6	84145	84150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488463
1111	NC_002682	CGA	2	6	84157	84162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488463
1112	NC_002682	TC	3	6	84348	84353	0 %	50 %	0 %	50 %	13488463
1113	NC_002682	GAG	2	6	84405	84410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488463
1114	NC_002682	GCG	2	6	84581	84586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488464
1115	NC_002682	TCG	2	6	84854	84859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488464
1116	NC_002682	GCG	2	6	84938	84943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488464
1117	NC_002682	A	6	6	85112	85117	100 %	0 %	0 %	0 %	13488464
1118	NC_002682	CAGC	2	8	85293	85300	25 %	0 %	25 %	50 %	13488465
1119	NC_002682	CCA	2	6	85385	85390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488465
1120	NC_002682	CGTT	2	8	85401	85408	0 %	50 %	25 %	25 %	13488465
1121	NC_002682	TGCG	2	8	85423	85430	0 %	25 %	50 %	25 %	13488465
1122	NC_002682	ACG	2	6	85563	85568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488465
1123	NC_002682	CCGG	2	8	85591	85598	0 %	0 %	50 %	50 %	13488465
1124	NC_002682	GGC	2	6	85605	85610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488465
1125	NC_002682	GGC	2	6	85694	85699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488465
1126	NC_002682	TCG	3	9	85703	85711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488465
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1128	NC_002682	CTC	2	6	85775	85780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488465
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1382	NC_002682	TGA	2	6	100290	100295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488477
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1500	NC_002682	CCA	2	6	107202	107207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488482

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